اساس کار میکروسکوپ ها بزرگنمائی اشیاء، مواد و مولکولها می باشند. اصول کلی در تمامی انواع میکروسکوپ ها براساس عبور نور با طول موج های متفاوت از چندین عدسی محدب می باشد که هر چقدر طول موج نور بکار رفته درمیکروسکوپ مزبور کوتاهتر باشد قدرت تفکیک و یا جداکنندگی آن بیشتر است.از انواع آن می توان به میکروسکوپ‌ های زمینه روشن، میکروسکوپ فلورسانس و میکروسکوپ الکترونی و… اشاره کرد.